热带鱼身上因皮下的鸟粪嘌呤晶体经光线反射，或由表皮的色素沉淀，而形成五彩缤纷的色彩，令人眼花撩乱，通常为鱼只价格的衡定标准。此外，鱼的颜色还有非常实际的用途：最基本的用处是识别同类及遇危险时的伪装，但也有的鱼为了掠食而模仿其他鱼的颜色。鱼类繁殖时颜色会变深些，以警告其他鱼离远一些；彩色图案也能帮助幼鱼认出牠们的父母。而鱼背部的颜色通常会较深，腹部则较浅，俯视时与河床混为一体，可有效地防范陆生食鱼动物的侵袭。